1月
7日 馬英九在出席臺灣日本人會(huì )及臺北市日本工商會(huì )“2009年新年聯(lián)誼酒會(huì )”時(shí)稱(chēng)，今年是臺灣和日本的“特別伙伴關(guān)系促進(jìn)年”，強調在其任內會(huì )好好發(fā)展臺日關(guān)系，建立互信。
8日 臺灣“陸委會(huì )副主委”趙建民在記者會(huì )上表示，由于索馬里亞亞丁灣海盜猖獗，臺灣正在評估由海軍派出軍艦，保護臺灣商船的航行安全。
13日 “美國在臺協(xié)會(huì )”表示任何船只遇險要求協(xié)助美國海軍皆有責任提供協(xié)助。
13日 世界衛生組織干事長(cháng)辦公室通知臺灣疾管局，將臺灣納入世界衛生條例當中，臺灣可以直接與世界衛生組織聯(lián)系。
14日 臺灣“監察院”調查“巴布亞新幾內亞建交案”發(fā)現，前“國安會(huì )秘書(shū)長(cháng)”邱義仁、前“外交部長(cháng)”黃志芳兩人“怠忽職守”，導致近3000萬(wàn)美元公款遭侵吞，故分別通過(guò)彈劾兩人案。
同日，臺灣特偵組就“侵占機密外交款案”將前“外交部政務(wù)次長(cháng)”高英茂改列圖利被告，并限制出境。
17日 美國貿易代表署宣布將臺灣自特別301觀(guān)察名單除名，對此“美臺商會(huì )”表示歡迎，認為臺灣在改善知識財產(chǎn)權上的進(jìn)展，是一項“臺灣能真正感到驕傲的成就紀錄”。
2月
4日 臺灣“外交部發(fā)言人”陳銘政表示，岡比亞、斯威士蘭等非洲4個(gè)“邦交國”計劃邀請馬英九訪(fǎng)問(wèn)，“外交部”將進(jìn)行評估。
同日 日本外務(wù)大臣麻生太郎稱(chēng)，臺灣今天擁有較高教育水平，得益于日本的殖民統治。
5日 中國外交部發(fā)言人孔泉說(shuō)，1894年甲午戰爭后，日本強行侵占臺灣，使臺灣島內民眾飽受奴役，給中華民族帶來(lái)了深重災難，這是世人皆知的事實(shí)。日本對臺灣長(cháng)達半個(gè)世紀的殖民統治，是日本軍國主義侵華歷史的黑暗一頁(yè)。作為加害國外交當局的最高負責人發(fā)表上述言論，是對歷史的歪曲，也是對中國人民感情的嚴重傷害。
6日 馬英九出席2009觀(guān)光節慶祝大會(huì )時(shí)表示，簡(jiǎn)化簽證程序，是吸引觀(guān)光客最重要的原因，目前臺灣正與美方積極洽商互免簽證計畫(huà)，希望拓展雙方觀(guān)光，同時(shí)他個(gè)人也多次利用接見(jiàn)歐盟國家代表機會(huì )，向對方表達互免簽證吸引觀(guān)光客的想法。
6日 臺灣“行政院長(cháng)”劉兆玄在聽(tīng)取“體委會(huì )”與臺北、高雄市簡(jiǎn)報“聽(tīng)障奧運會(huì )”與“世界運動(dòng)會(huì )”籌辦情況后，指示各“部會(huì )”全力配合，要求“外交部”突破邀訪(fǎng)外賓的人數限制，并加強國際宣傳，“向全世界展現臺灣打拚精神”。
17日 馬英九表示，日本給臺灣民眾免簽證待遇后，帶動(dòng)雙方觀(guān)光人次增加，希望美國也能給予臺灣民眾免簽證待遇。
23日17位美國眾議員連署提案，重申“信守《與臺灣關(guān)系法》作為美國對臺灣關(guān)系的基石”，“支持臺灣民主體制”。對此，臺灣“駐美代表處”表達“感激與歡迎”。
26日 中斷超過(guò)3年半的臺、日第16次漁業(yè)會(huì )談在臺北舉行，臺灣希望這次會(huì )談能擱置釣魚(yú)島主權問(wèn)題，雙方獲得“共同管理爭議海域”、“解決漁業(yè)糾紛”的共識。
同日 日本外務(wù)大臣麻生太郎在眾議院預算委員的一次會(huì )議上宣稱(chēng)，將與美國協(xié)商把釣魚(yú)島納入“日美安保條約”保護范圍。中國外交部發(fā)言人馬朝旭即表示，中方對此強烈不滿(mǎn)，已向日方提出嚴正交涉。
27日 對于麻生太郎的說(shuō)法，臺灣“外交部”予以駁斥，重申“中華民國政府”擁有釣魚(yú)臺“主權”。
3月
3日 英國自即日起給予臺灣民眾6個(gè)月赴英國免簽證待遇，而臺灣自1993年起就開(kāi)放英國國民來(lái)赴臺免簽證30天。
5-10日 臺灣“外交部長(cháng)”歐鴻煉出訪(fǎng)巴拉圭和多米尼加。
16-18日 “美國在臺協(xié)會(huì )理事主席”薄瑞光（Raymond F. Burghardt）訪(fǎng)問(wèn)臺灣，會(huì )見(jiàn)臺灣政商界人士。18日，在拜會(huì )馬英九和蔡英文等朝野領(lǐng)袖時(shí)，對目前臺美關(guān)系給了“極好”評價(jià)，并強調兩岸穩定與對話(huà)的重要性。
20日 馬英九與媒體茶敘時(shí)表示，“追求雙重承認不切實(shí)際、也不是我的目標”，“政府推動(dòng)參與世衛組織若涉主權爭議，解決方案就是‘九二共識’”。
23日 臺灣“調查局臺北市調處”前往臺北看守所，就“侵占機密外交款案”訊問(wèn)陳水扁。
25日 美國國防部提出中國軍力報告，指中國軍隊仍以臺灣為假想敵，部署導彈逾1050枚，逾三分之一重兵部署于臺海。
31日 臺灣“立法院”審查通過(guò)了《經(jīng)濟社會(huì )與文化權利國際公約》及《公民政治權利國際公約》兩項國際公約。
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